Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SIM1P81133 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SIM1P81133 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms