Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ARF3P61204 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ARF3P61204 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ARF3P61204 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms