Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CASP4P49662 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CASP4P49662 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CASP4P49662 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms