Protein–RNA interactions for Protein: P49005

POLD2, DNA polymerase delta subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD2P49005 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLD2P49005 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLD2P49005 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLD2P49005 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLD2P49005 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLD2P49005 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLD2P49005 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms