Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CRATP43155 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CRATP43155 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CRATP43155 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms