Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MLH1P40692 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MLH1P40692 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MLH1P40692 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MLH1P40692 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MLH1P40692 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms