Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CCDC159P0C7I6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms