Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SGTAO43765 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms