Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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PHF1O43189 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PHF1O43189 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PHF1O43189 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PHF1O43189 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PHF1O43189 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PHF1O43189 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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PHF1O43189 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PHF1O43189 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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