Protein–RNA interactions for Protein: O00445

SYT5, Synaptotagmin-5, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT5O00445 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SYT5O00445 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SYT5O00445 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms