Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC12□□□□□ -0.49
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