Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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C4orf47A7E2U8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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C4orf47A7E2U8 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
C4orf47A7E2U8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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