Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G9

DYNC1LI1, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI1Q9Y6G9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
DYNC1LI1Q9Y6G9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DYNC1LI1Q9Y6G9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DYNC1LI1Q9Y6G9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms