Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y646

CPQ, Carboxypeptidase Q, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPQQ9Y646 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CPQQ9Y646 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CPQQ9Y646 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CPQQ9Y646 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms