Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RAD54BQ9Y620 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RAD54BQ9Y620 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RAD54BQ9Y620 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD54BQ9Y620 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms