Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PCDHB5Q9Y5E4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PCDHB5Q9Y5E4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PCDHB5Q9Y5E4 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms