Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4M8

LINC00588, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00588, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00588Q9Y4M8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
LINC00588Q9Y4M8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LINC00588Q9Y4M8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms