Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y376

CAB39, Calcium-binding protein 39, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39Q9Y376 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAB39Q9Y376 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CAB39Q9Y376 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CAB39Q9Y376 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.4 ms