Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFAF1Q9Y375 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
NDUFAF1Q9Y375 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NDUFAF1Q9Y375 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms