Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y9

KLF13, Krueppel-like factor 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF13Q9Y2Y9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KLF13Q9Y2Y9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
KLF13Q9Y2Y9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLF13Q9Y2Y9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms