Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KLHDC2Q9Y2U9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLHDC2Q9Y2U9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms