Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
KDM2AQ9Y2K7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC34.32■■■■□ 3.09
KDM2AQ9Y2K7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KDM2AQ9Y2K7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
KDM2AQ9Y2K7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
KDM2AQ9Y2K7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms