Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSX2IPQ9Y2D8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SSX2IPQ9Y2D8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SSX2IPQ9Y2D8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SSX2IPQ9Y2D8 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms