Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
EIF3LQ9Y262 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EIF3LQ9Y262 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EIF3LQ9Y262 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms