Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
SHANK2Q9UPX8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
SHANK2Q9UPX8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SHANK2Q9UPX8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC35.98■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
SHANK2Q9UPX8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SHANK2Q9UPX8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms