Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTF2Q9UNY4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TTF2Q9UNY4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TTF2Q9UNY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms