Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
L1RE1Q9UN81 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
L1RE1Q9UN81 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
L1RE1Q9UN81 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms