Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SYNPO2Q9UMS6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SYNPO2Q9UMS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SYNPO2Q9UMS6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms