Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RIMKLBQ9ULI2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RIMKLBQ9ULI2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RIMKLBQ9ULI2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.5 ms