Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDH7Q9ULB5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDH7Q9ULB5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CDH7Q9ULB5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms