Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX7

NUP50, Nuclear pore complex protein Nup50, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50Q9UKX7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP50Q9UKX7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP50Q9UKX7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
NUP50Q9UKX7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NUP50Q9UKX7 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms