Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FBXO4Q9UKT5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FBXO4Q9UKT5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FBXO4Q9UKT5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FBXO4Q9UKT5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms