Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK17

KCND3, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND3Q9UK17 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCND3Q9UK17 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KCND3Q9UK17 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCND3Q9UK17 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms