Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TUBD1Q9UJT1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TUBD1Q9UJT1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBD1Q9UJT1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms