Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
RPUSD1Q9UJJ7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RPUSD1Q9UJJ7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RPUSD1Q9UJJ7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
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