Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDH22Q9UJ99 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDH22Q9UJ99 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDH22Q9UJ99 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms