Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCOCQ9UIL1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCOCQ9UIL1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCOCQ9UIL1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms