Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATPIF1Q9UII2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATPIF1Q9UII2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ATPIF1Q9UII2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms