Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD2

TBK1, Serine/threonine-protein kinase TBK1, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBK1Q9UHD2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TBK1Q9UHD2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TBK1Q9UHD2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TBK1Q9UHD2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms