Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FBXO40Q9UH90 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FBXO40Q9UH90 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FBXO40Q9UH90 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FBXO40Q9UH90 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms