Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH77

KLHL3, Kelch-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL3Q9UH77 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL3Q9UH77 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLHL3Q9UH77 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL3Q9UH77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms