Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH65

SWAP70, Switch-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWAP70Q9UH65 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SWAP70Q9UH65 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SWAP70Q9UH65 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SWAP70Q9UH65 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms