Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH64

CDKN2A-AS1, Susceptibility protein NSG-x, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDKN2A-AS1Q9UH64 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CDKN2A-AS1Q9UH64 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms