Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGT4

SUSD2, Sushi domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD2Q9UGT4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SUSD2Q9UGT4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SUSD2Q9UGT4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SUSD2Q9UGT4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SUSD2Q9UGT4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD2Q9UGT4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD2Q9UGT4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD2Q9UGT4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD2Q9UGT4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SUSD2Q9UGT4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms