Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CGGBP1Q9UFW8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CGGBP1Q9UFW8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CGGBP1Q9UFW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
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