Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY0

SLC9A2, Sodium/hydrogen exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A2Q9UBY0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC9A2Q9UBY0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC9A2Q9UBY0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC9A2Q9UBY0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.8 ms