Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ5

EIF3K, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit K, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3KQ9UBQ5 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
EIF3KQ9UBQ5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
EIF3KQ9UBQ5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
EIF3KQ9UBQ5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126 ms