Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MGAT4CQ9UBM8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MGAT4CQ9UBM8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MGAT4CQ9UBM8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms