Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBL6

CPNE7, Copine-7, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE7Q9UBL6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE7Q9UBL6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPNE7Q9UBL6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE7Q9UBL6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms