Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KLHL13Q9P2N7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KLHL13Q9P2N7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
KLHL13Q9P2N7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms